舞台是在某个国家的某个地区莫斯特城市。 在陈旧大楼的二楼有一家发行《月刊妄想科学》的小出版社。 《月刊妄想科学》是一本异想天开，报道“真是吓人一跳！”的事件、即使是科学家也会发出“要不行啦！”声音的超科学现象的科学杂志。 工作人员只有帅哥主编兼编辑的塔罗·J·铃木。再加上小学生助手吉罗·田中和狗狗三郎。 编辑部一直是空的，塔罗、吉罗和三郎都沉浸在同一栋大楼1F的咖啡馆《岩石（ROCK）》中。 有一天，科学家戈洛·佐藤前来咨询，由此开始了一个异想天开的故事……。
《阿优之兔智来了2》的故事延续《阿优之神奇萝卜》系列，故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，博士怀疑是巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛周围的岛屿上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了重要作用。但是兔菲依旧不放弃自己的梦想，他带领手下跳跳和甩耳开着飞行器一路跟随阿U他们，发誓要得到超级萝卜。
大家最喜欢的小猎犬回来了!
在迷糊博士的指导下，猪猪侠与各种奇异的外星人接触相识，他和铁拳虎解决了孤独星人、量子星人、全城电子产品失灵等事件所带来的危机后，猪猪侠与伙伴们处理突发事件的能力得到了锻炼，逐渐成为一名合格的星际特工。迷糊博士本是超好玩联盟的创始人之一，为了躲避联盟首脑的通缉一直躲藏在童话星球，然而这一天，联盟的人终于找到迷糊老师藏身之处，由于双方实力差距悬殊，猪猪侠保护不了铁拳虎，连自己与伙伴都有生命危险，最后铁拳虎主动走向了联盟，以自己的心核换得大家的安全。
男鹿辰己（小西克幸 配音）就读于石矢魔高校一年级，是一个眼神凶恶个性粗暴的不良少年。这一天，刚刚在河边结束了一场斗殴的男鹿发现河面上居然飘来了一个长相十分可疑的大叔，更让男鹿震惊的是，大叔的体内居然产出了一个小小的婴儿！大叔告诉男鹿自己名叫阿兰德隆（高木涉 配音），婴儿名叫小贝鲁（泽城美雪 配音），他们来自魔界，而此行的目的就是毁灭全人类！ 莫名其妙之中，男鹿与小贝鲁签订了契约成为了小贝鲁的奶爸，这一颠覆性的改变让男鹿觉得十分头痛。随后，身材和个性都很火爆的恶魔女仆希露迪（伊藤静 配音）来到了男鹿身边。一面要对抗校园中的黑帮团体，一边又要照顾个性别扭的小贝鲁，男鹿惊险又温馨的奶爸生活即将拉开序幕。
在赌上学校存续的大学选拔队战役中胜利後，大洗女子学园战车道成员终於能好好享受和平悠闲的冬季。迎接三年级生毕业典礼的到来，包含学生会改选与新执行部门的动作，学校开始发生些微的变化。有一天，一场骚动来访少女们。为了下一波难题与困难，战车道成员们再次挺身而出迎接挑战。
当代代相传的家族诅咒将亚历克斯·范德霍文变成石头时，他的两个孩子潘多拉和拉斯以及他的妻子斯基要把祖先偷走的文物归还给他们的合法家园，最终彻底解除诅咒。
转生者妲莉亚‧罗希迪被未婚夫背叛， 她下定决心「再也不要向人低头」，要自由自在开始新的生活。 去自己想去的地方，吃自己想吃的美食， 还有制作自己最喜欢的魔导具。 史莱姆的防水布、小型魔导炉、人工魔剑还有妖精结晶的眼镜… 妲莉亚活用转生前的知识，发明出各种创新的魔导具， 让异世界的人们生活更加便利。 产品制造×异世界转生的幻想舞台！
狮子亚历克斯他们在马达加斯加的快乐故事仍在继续。而另一边厢，那四只调皮捣蛋的企鹅：沉着冷静的老大（Tom McGrath 配音）、脑瓜机灵的技术狂卡哇伊（Jeff Bennett 配音）、单纯而超梦的菜鸟（James Patrick Stuart 配音）以及疯狂危险的凉快（John DiMaggio 配音）却回到了纽约动物园。虽然平时被关在笼中，但这根本难不住技能互补的企鹅四兄弟，在繁华的国际大都会，他们还是可以让演一场又一场令人咋舌又拍案叫绝的大冒险。此外，超级自恋狂狐猴朱利安国王14世和大毛也告别老家，携手到陌生的美国闯天下。动物、人类，原始、文明，彼此间发生激烈碰撞，有趣的故事接连上演…… 本片为动画电影《马达加斯加》的衍生剧。
棒球巨星佐藤建回到家乡日本，接手成为超级英雄奥特曼，担当保卫地球的任务，却很快就发现工作不如想像中简单，因为他被迫抚养头号大敌留下的孩子。
