第二季的故事是发生在第一季的故事结束后三年，爱良等人从Pretty Top演艺学校结业并学有所成，之后有了全新生力军的加入，包含了玲奈、果铃、彩海三人组成的团队“三棱镜伴侣（Prism Mates、プリズムメイツ）”，与后来加入的美爱，演变成四人明星团体“Prizmmy☆”并走上成名之路；后来有来自韩国的五位女性留学生加入了Pretty Top演艺学院，并与Prizmmy☆四人连袂演出。
精灵宝可梦，简称宝可梦， 这颗星球上非常非常不可思议的生物， 在天空、大海、森林、街道之中到处都能看到它们的身影。 持有不可思议吊坠的来自帕底亚的少女——莉可。 持有神秘精灵球的来自关都的少年——罗伊。 以广阔的宝可梦世界为舞台， 莉可和罗伊的新冒险开始了！ 等待两人的相遇，还有命运是—！？ 这是一个通过冒险“找到”重要的东西的故事。
